修持药师经有多种方法，虽然有多种方法，但是，我们只需要选择适合自己的修持药师经的方法，因为它们的效果都是一样的，并且都是为了使众生脱离苦海，远离劫难，但是，在修持药师经时，一定要有诚心。那么药师经该如何修持呢?

以下略述修持课仪，分为七门。其中，礼敬、赞叹、供养、回向、发愿，必须行之;诵经、持名、持咒，可随己意，或惟修二法，或仅修一法，皆可。

一、礼敬

十方三宝一拜，或分礼佛法僧三拜。本师释迦牟尼佛一拜，药师琉璃光如来三拜。此外若欲多拜，或兼礼敬其他佛菩萨者，随己意增加。

礼敬之时，须至诚恭敬，缓缓拜起，万不可匆忙，宁可少拜，不可草率。

二、赞叹

礼敬既毕，于佛前长跪合掌，唱赞偈云：

归命满月界　净妙琉璃尊

法药救人天　因中十二愿

慈悲弘誓广　愿度诸含生

我今申赞扬　志心头面礼

上赞偈出《药师如来消灾除难念诵仪轨》，唱赞之时，声宜迟缓，宜庄重。

三、供养

赞叹既毕，于佛前长跪合掌，唱供养偈云：

愿此香花云　遍满十方界

一一诸佛土　无量香庄严

具足菩萨道　成就如来香

供养毕，或随己意增诵《忏悔文》，或可略之。

四、诵经

字音不可讹误，宜详考之。

诵经时，或跪或立，或坐或经行，皆可。

五、持名

先唱赞偈云：

药师如来琉璃光　焰网庄严无等伦

无边行愿利有情　各遂所求皆不退

续云“南无东方净琉璃世界药师琉璃光如来”，以后即持念“药师琉璃光如来”名号一百八遍，若欲多念者随意。

六、持咒

或据经中译音持念，或别依师学梵文原音持念，皆可。

或念全咒一百八遍;或先念全咒七遍，继念心咒一百八遍，后复念全咒七遍。心咒者，即是咒中唵字以下之文。

未经密宗阿阇黎传授，不可结手印，擅结者有大罪。

持咒时，不宜大声，惟令自己耳中得闻。

持咒时，以坐为正式，或经行亦可。

七、回向发愿

回向与发愿大同，故今并举。其稍异者，回向须先修功德，再以此功德回向，惟愿如何云云。若先未作功德者，仅可云发愿也。

回向发愿，为修持者最切要之事。若不回向，则前所修之功德无所归趣。今修持药师如来法门者，回向之愿各随己意。凡《药师经》中所载者皆可发之，应详阅经文，自适其宜可耳。

通过以上的讲述我们可以知道修持药师经的方法，其实修持药师经有很多好处，而且修持药师经可以让我们求有所得，也可以保佑我们平平安安，同时还要知道药师经的功德利益有哪些，有利于我们对药师经的修持。以上如有不正确之处请多多包涵。